Rol de las variantes del receptor de la prostaglandina D en la susceptibilidad al asma

Antecendentes:

En estudios genéticos previos, la región del genoma humano (14q22.1) donde se encuentra el gen que contiene el receptor prostanoide de la prostaglandina D (PTGDR) fue asociada con el asma. Un estudio en base a un modelo con ratones, sugiere que se requiere de un receptor para que el fenotipo del asma se manifieste. Nuestra asociación del asma con las variantes genéticas funcionales del PTGDR se relacionan con estos estudios. 

Métodos:

Se identificaron y evaluaron combinaciones de variantes genéticas que modifican la transcripción del PTGDR para la asociación con la enfermedad en estudios de casos - controles de 518 pacientes asmáticos blancos, 175 pacientes blancos de control, 80 pacientes asmáticos de color y 45 pacientes de color de control.  

Resultados:

Identificamos cuatro nuevos polimorfismos de nucleótidos simples (SNP) y otros dos previamente informados, del PTGDR y sus proximidades. Éstos definen cuatro haplotipos de tres SNP comunes, cuya habilidad para tolerar la transcripción del PTGDR varía y que tienen diferentes perfiles de afinidad para la proteína ligadora de ADN. Algunos SNP del PTGDR individuales fueron significativamente asociados con el asma en ambas poblaciones.

Algunos haplotipos específicos de PTGDR fueron significativamente asociados con el diagnóstico de asma en un amplio estudio de casos - controles en pacientes blancos (P=0,002); estos hallazgos fueron confirmados en una segunda población de pacientes de color (P=0,01). Análisis multivariantes de las combinaciones de haplotipo (diplotipos) demuestran que tanto los pacients blancos (odds ratio, 0,55; intervalo de confianza 95%, 0,38 a 0,80; P=0,002) como los de color (odds ratio, 0,32; intervalo de confianza 95%, 0,12 a 0,89; P=0,03) que tenían al menos una copia del haplotipo con una eficacia de transcripción baja corrían un menor riesgo de desarrollar asma, que aquéllos que no contaban con una copia del haplotipo.

Conclusiones: Nuestros hallazgos funcionales y genéticos identifican al PTGDR como un gen susceptible para el asma.