La disbiosis respiratoria se asocia con peores resultados en pacientes en ARM

La disbiosis del tracto respiratorio se asocia con peores resultados en pacientes con ventilación mecánica

Justificación:

Las respuestas inflamatorias del huésped se han asociado fuertemente con resultados adversos en pacientes críticamente enfermos, pero no se han definido los fundamentos biológicos de tales respuestas heterogéneas.

Objetivos:

Examinamos si los perfiles del microbioma del tracto respiratorio están asociados con la inflamación del huésped y los resultados clínicos de la insuficiencia respiratoria aguda.

Métodos:

Recolectamos hisopos orales, aspirados endotraqueales (ETA) y muestras de plasma de pacientes ventilados mecánicamente.

Realizamos la secuenciación del gen de ARN ribosómico 16S para caracterizar la microbiota del tracto respiratorio superior e inferior y clasificamos a los pacientes en subfenotipos de respuesta del huésped sobre la base de variables clínicas y biomarcadores plasmáticos de inmunidad innata e inflamación.

Derivamos métricas de diversidad y grupos de composición con modelos multinomiales de Dirichlet y examinamos nuestros datos en busca de asociaciones con subfenotipos y resultados clínicos.

Mediciones y resultados principales:

Las comunidades microbianas orales y ETA de 301 sujetos ventilados mecánicamente tuvieron una heterogeneidad sustancial en la diversidad α y β.

Los modelos multinomiales de Dirichlet revelaron un grupo con baja diversidad α y enriquecimiento de patógenos (p. Ej., Alta abundancia relativa de Staphylococcus o Pseudomonadaceae) en el 35% de las muestras de ETA, asociado con un subfenotipo hiperinflamatorio, peor supervivencia a los 30 días y mayor tiempo de liberación de los efectos mecánicos. ventilación (P ajustado <0,05), en comparación con pacientes con mayor diversidad α y abundancia relativa de microbiota oral típica.

Los pacientes con evidencia de disbiosis (diversidad α baja y abundancia relativa baja de bacterias comensales de origen oral "protectoras") tanto en muestras orales como ETA (17%, disbiosis combinada) tuvieron una supervivencia de 30 días significativamente peor y un tiempo más prolongado hasta la liberación de ventilación que los pacientes sin disbiosis (55%; P ajustado <0,05).