Estudios de asociación genéticas

Se consideraron tres estudios para determinar la asociación genética en datos de familias nucleares (el Estudio de Asociación Basado en la Familia (FBAT) propuesto por Rabinowitz y Laird ([2000] Hum. Hered. 50:211-223), un segundo estudio propuesto por Rabinowitz ([2002] J. Am. Stat. Assoc. 97:742-758) y el estudio de puntaje parcial del Programa de Análisis de Genotipo Familiar (FGAP) de Clayton ([1999] Am. J. Hum. Genet. 65:1170-1177) y Whittemore y Tu ([2000] Am. J. Hum. Genet. 66:1329-1340)).

Se demostró que cada estudio se presenta estadísticamente en la clasificación eficiente de datos familiares como la solución a un grupo de problemas con expectativa nula. Además, los estudios FBAT y de Rabinowitz (aunque no el de FGAP) son localmente los más poderosos entre todos los estudios para resolver estos problemas.

Se utilizaron estimulaciones para examinar de qué manera estos tres estudios se comportan en situaciones donde sus asunciones fueron violadas y la cantidad de familias no es grande. Se encontró que el estudio de FBAT tendió a tener menor poder que los otros dos, especialmente cuando se aplicó en familias en las cuales todos los descendientes estaban afectados. Los estudios de Rabinowitz y de FGAP se realizaron de manera similar, a pesar de que éste último tendió a extraer más información de las familias que contenían un pariente tipificado. Mientras ninguno de los estudios mostró un buen rendimiento en la detección de genes de actuación recesiva poco frecuentes, el estudio de Rabinowitz con una estimación variable de la muestra se comportó especialmente pobre en este caso. Sin embargo, el estudio de Rabinowitz con una variación basada en el modelo mostró un poder comparable al del estudio FGAP e índices de error tipo I precisos.

Se concluyó que para las situaciones consideradas, el estudio de Rabinowitz con una variación basada en el modelo tiene un buen poder sin perder consistencia contra la falta de especificación de las probabilidades genotípicas familiares. Sin embargo, esta utilidad está limitada por la falta de un algoritmo simple de aplicar en familias con estructuras y fenotipos variables.