Detectan la variante de SARS.COV2 del Reino Unido en el país

Reporte N°12: Vigilancia activa de variantes de SARS-CoV-2 en Argentina. Reporte de caso. Actualización al 15/01/2021.

Durante las últimas semanas, la emergencia de variantes virales del SARS-CoV-2 han llamado la atención de la comunidad científica y de los gobiernos nacionales:

● La variante VOC 202012/01 o variante 501Y.V1 (linaje B.1.1.7), cuya muestra más antigua fue detectada en el Reino Unido el 20/09/2020 (Rambaut y col., 2020). Esta variante ya ha sido reportada al día 15 de enero de 2021 en 54 países incluidos Brasil y Chile, dentro de América del Sur.

● La variante VOC 202012/02 o variante 501Y.V2 (linaje B.1.351), detectada en Sudáfrica desde el 08/10/2020 (Tegally y col., 2020). Esta variante ha sido reportada 22 países hasta el momento, ninguno del continente americano.

● La variante 501Y.V3 (linaje P.1, derivado del linaje B.1.1.28), cuya muestra más temprana corresponde al día 16/12/2020, detectada en Brasil (Manaos, Estado de Amazonas) y en Japón (Faria y col., 2021).

● La variante de Río de Janeiro (derivada del linaje B.1.1.28), detectada Río de Janeiro, Brasil, desde octubre de 2020 (Voloch y col., 2020). Actualmente, esta variante ha sido detectada en 9 países, incluida la República Argentina.

Con el objetivo de continuar con la vigilancia activa de las variantes mencionadas a través de la secuenciación parcial del gen de la proteína Spike del SARS-CoV-2, se recibió para su análisis un caso proveniente de un viajero que había arribado al aeropuerto de Ezeiza y que a través del Dispositivo Turistas Ezeiza había sido positivo para SARS-CoV-2 por test de antígenos y posterior confirmación por qRT-PCR en laboratorio.

Se describe el caso de un argentino residente en Reino Unido con antecedentes de viaje en el último tiempo a Austria y Alemania por razones laborales, que arriba asintomático a la Argentina desde Frankfurt a finales de diciembre del 2020. En Ezeiza resulta positivo para antígenos de SARS-CoV-2, posteriormente confirmado por qRT-PCR en laboratorio. La secuenciación del gen S confirmó la presencia de la variante VOC 202012/01 (Reino Unido) (linaje B.1.1.7), siendo la primera vez que se detecta en el país.

Resultados: 
Descripción del caso 

Argentino residente en Reino Unido con antecedentes de viaje en el último tiempo a Austria y Alemania por razones laborales, arriba a la Argentina desde Frankfurt a finales de diciembre del 2020. 

Paciente asintomático en EZEIZA se le realiza a través del Dispositivo Turistas Ezeiza, un test de antígenos en saliva que resulta positivo. Posteriormente se le realiza la confirmación por qRT-PCR en muestra de saliva en el Laboratorio de Biología Molecular del Hospital Pedro de Elizalde. Se le indica cuarentena que cumple en un domicilio de CABA.

A través de la metodología propuesta de secuenciación del gen de la proteína S se detectaron las mutaciones características de la variante VOC202012/01 (Reino Unido), perteneciente al linaje B.1.1.7. Las mutaciones detectadas en las secuencia obtenida son: S_HV69-70del, S_Y144del, S_N501Y, S_A570D, S_D614G, S_P681H, S_T716I, S_S982A, S_D1118H. Si bien las mutaciones detectadas son confirmatorias de la variante, la muestra está siendo procesada en el nodo de secuenciación del INTA-CONICET de Rafaela para la obtención del genoma completo de SARS-CoV-2 que será incorporado a la base de datos GISAID a la brevedad.

Conclusión

Mediante la estrategia de vigilancia activa de las variantes de SARS-CoV-2 se ha detectado el ingreso al país de la variante VOC202012/01 (Reino Unido) en un individuo residente de Reino Unido proveniente de Alemania. Actualmente, las autoridades sanitarias se encuentran realizando las investigaciones epidemiológicas pertinentes al caso.

Se evidencia la importancia de cumplir con las disposiciones sanitarias de aislamiento obligatorio en caso de viaje, y de distanciamiento físico, uso de tapabocas y ventilación de ambientes.

El Consorcio Argentino Interinstitucional de Genómica de SARS-CoV-2 continuará realizando la vigilancia molecular en tiempo real sobre los casos de circulación comunitaria, así como casos de viajeros provenientes del exterior con la estrategia planteada, a la par que seguirá caracterizando los genomas de SARS-CoV-2 que han circulado desde el inicio de la epidemia en diferentes regiones del país. Asimismo, la vigilancia molecular en tiempo real permitirá determinar la posible emergencia de nuevas variantes virales locales.

Participantes en este reporte: Nodo secuenciación HNRG: Mercedes Nabaes; Laura Valinotto; Stephanie Goya; Mónica Natale; Silvina Lusso, Sofía Alexay; Mariana Viegas. Nodo evolución: Carolina Torres, Paula Aulicino, Guido König, Humberto Debat, Mariana Viegas.