Se conocen y se han estudiado los distintos mecanismos que regulan la motilidad del esófago, los efectos de los neurotransmisores, las hormonas y el sistema nervioso enterico.
Las alteraciones de la motilidad por alguna razon anatomica y/o funcional conducen inexorablemente a la presentacion de reflujo, que puede ser sintomatico o no. Un 25% de los estudios radiologicos contrastados (S.G.D.) presentan algun grado de reflujo de la sustancia baritada en pacientes totalmente asintomaticos.
Por lo expuesto resulta razonable y logico determinar fehacientemente el tipo y magnitud del reflujo como causa-efecto de disturbios digestivos y/o extra digestivos.
El medico tratante se debe formular distintas preguntas y en funcion de las mismas establecer el orden de practicas, estudios o test para dar respuestas a las mismas.

A)Es anormal el reflujo que presenta el paciente?

1-Seriada gastroduodenal con transito esofagico
2-Centellograma radioisotopico con Tc99
3-Test basico de la acidez del reflujo
4-Monitoreo del pH durante 12 o 24hs
5-Manometria esofagica

B)Hay lesion de la mucosa esofagica por el reflujo?

1- Seriada gastroduodenal con transito esofagico
2-Endoscopia
3-Biopsia de mucosa
4-Diferencia del potencial ionico del epitelio lesionado

C)La sintomatología que presenta el paciente es atribuida  al reflujo?

1-Test de Berstein
2-Monitoreo del pH durante 12 o 24hs
3-Manometria esofagica

D)Pronostico de la enfermedad con el tratamiento medico o alternativa quirurgica

1-Grado de respuesta del reflujo al tratamiento medico
2-Monitoreo del pH durante 12 o 24hs intratamiento
3-Grado de lesiones de la mucosa, falta de respuesta al tratamiento medico, lesiones metaplasicas 
4-Complicaciones: estrechez, sangrado,etc.

Una vez categorizado y valorado el reflujo esofagico analicemos su repercusion en pacientes con patologías respiratorias asociadas.
El reflujo gastroesofagico y la hernia hiatal son patologías muy frecuentas en los adultos y con el avance de la edad.

Dichas manifestaciones comprometen funcionalmente a pacientes con EBOC. En algo menos del 50% de los pacientes que presentan ambas patologías es posible detectar microaspiraciones de contenido acido digestivo en via aerea. Esta  circunstancia es una de las causas comunes de tos seca y persistente y que solo se modifica con el tratamiento y control del reflujo gastroesofagico.

Pero tambien la presencia de contenido gastrico, biliar o pancreatico en via aerea puede generar procesos inflamatorios severos de la mucosa , teniendo como respuesta reaccional cambios en el calibre de los bronquios (roncus y sibilancias) en los sectores afectados o bien modificacion de las carateristicas de las secresiones respiratorias con aumento de la viscosidad y la posibilidad de hacer tapones mucosos (atelectasias segmentaria o subsegmentarias), posibilitando la sobreinfeccion.

Por lo expuesto es posible establecer la siguiente secuencia fisiopatologica:
 1-Taponamiento mucoso
 2-Infeccion
 3-Engrosamiento de la pared bronquial
 4-Broncoespasmo

Tambien el equilibrio Acido Base puede afectarse por la liberación de hidrogeniones (H+) que sumado a los generados por la actividad catalitica de la anhidrasa carbonica pueden modificar el pH de no ser por la union a la hemoglobina y un equilibrio entre la excrecion y la generacion de bicarbonato por los riñones.