Ventaja del análisis por haplotipo

Alelos de susceptibilidad múltiple

Nuevos modelos estadísticos basados en haplotipos ayudarán en la evaluación de potenciales métodos de asociación para identificar y localizar genes enfermos complejos.

Autor/a: Dres. Morris RW, Kaplan NL

Fuente: Genet. Epidemiol. 2002; 23 (3): 221-233

Investigadores estadounidenses estudiaron recientemente el efecto de alelos de susceptibilidad múltiple en un locus de enfermedad único, sobre el poder estadístico de una prueba de tasas de probabilidad para detectar la asociación entre alelos de un locus marcador y de un fenotipo enfermo, en un diseño de control de casos.

A través del uso de suposiciones simplificadas para obtener la distribución de la frecuencia de unión de alelos de locus enfermos y marcadores, los investigadores presentaron resultados numéricos que ilustran el impacto de la variación histórica de asociaciones iniciales entre alelos marcadores y alelos susceptibles, sobre el poder de una prueba de tasas de probabilidad para esta asociación.

Los resultados mostraron que un incremento en el número de alelos susceptibles produce una disminución en el poder de la prueba de tasas de probabilidad. La disminución del poder en presencia de alelos de susceptibilidad múltiple, sin embargo, es menor para los marcadores con alelos múltiples que para los marcadores con dos alelos.

Los investigadores evaluaron las implicaciones de esta observación para estudios de la asociación basados en haplotipos hechos para polimorfismos de nucleótidos únicos fuertemente ligados (SNPs). Los resultados alcanzados sugieren que un análisis basado en haplotipos podría ser ventajoso sobre un análisis basado en SNPs individuales en presencia de alelos de susceptibilidad múltiple, particularmente cuando el desequilibrio en la unión entre los SNPs es débil.

Es importante desarrollar nuevos modelos estadísticos basados en haplotipos para la evaluación de potenciales métodos de asociación para identificar y localizar genes enfermos complejos.