La parotiditis supurativa es rara en los recién nacidos. Los organismos predominantes son Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Pseudomona auruginosa y Streptococo grupo B.
Si bien se han aislado bacterias anaerobias en niños más grandes y adultos con parotiditis supurativa, estas muestras fueron obtenidas por compresión del conducto de Stensen, pudiéndose contaminar la muestra con especimenes de la flora oral.

Las muestras de los pacientes descriptos en este informe fueron obtenidos a través de la aspiración de la glándula infectada, evitando de esta manera la contaminación de la muestra por gérmenes de la flora oral.

El aislamiento de bacterias anaerobias no es sorprendente debido a que las mismas son predominantes en la región orofaringea en donde ellos exceden en una proporción de 10:1 a 100:1 en el neonato. Especies de Prevotella son los organismos más comúnmente encontrados en la flora oral, se trata de bacilos Gram negativos anerobios que junto con especies de Peptostreptococos frecuemtemente se aíslan de las infecciones odontógenas.

La administración de la terapia antimicrobiana  es una parte esencial en el tratamiento de los pacientes con parotiditis supurativa. La elección del antibiótico depende del agente etiológico. La mayoría de los casos responde al tratamiento médico, sin embargo, a veces la glándula inflamada puede abscedarse, requiriendo en este caso drenaje quirúrgico. La terapia empírica anti estafilococo utilizando penicilina resistente a las beta-lactamas se indica en todos los casos, también puede ser necesario para estreptococos hemolíticos y bacterias anaerobias.

Una penicilina resistente a las bete-lactamasas o una cefalosporina de primera generación es generalmente adecuado para el S. aureus. Sin embargo la presión de los staphilococos meticilino resistente puede indicar el uso de vancomicina. Clindamicina, cefoxitina, imipenen, la combinación de metronidazol y un macrólido o una penicilina con un inhibidor de las beta- lactamasas resultan tratamientos adecuados para anaerobios así como para las bacterias aeróbios.