Biomarcadores + modelos matemáticos | 17 SEP 12

Kit para el diagnóstico precoz del cáncer de colon

Han utilizado técnicas de estadística avanzada y minería de datos para filtrar la información procedente de la actividad de más de 22.000 genes y han conseguido diferenciar con un 94.45% de precisión muestras tumorales de no tumorales.

Los investigadores Rubén Armañanzas y Pedro Larrañaga del Computational Intelligence Group de la Facultad de Informática de la Universidad Politécnica de Madrid.

Fig.1: Placa de vidrio de un chip de ADN (DNA microarray) antes de ser utilizado. © R. Armañanzas La UPM participa así en un esfuerzo conjunto entre varias instituciones españolas para la consecución de un test genético de rápido diagnóstico para el cáncer de colon. El objetivo del estudio es desarrollar un dispositivo de bajo coste que integre la medición de los biomarcadores con los modelos matemáticos.

En la actualidad el diagnóstico del cáncer de colon está fundamentalmente basado en el resultado de biopsias de pólipos recogidos durante una colonoscopia. Sin embargo, este diagnóstico resulta en muchas ocasiones tardío y muy invasivo.

El estudio se inició con el análisis de la actividad genética de más de 22.000 genes simultáneamente mediante el uso de chips de ADN (del inglés, DNA microarrays). Toda esta información fue filtrada utilizando técnicas de estadística avanzada y minería de datos de alta dimensionalidad. Se identificó de esta manera un subconjunto reducido de genes que presentaban comportamientos diferenciados entre las muestras tumorales y las no tumorales. La combinación de sus patrones de expresión mediante modelos matemáticos complejos permite la creación de un clasificador o predictor del diagnóstico. En base a dicho panel de genes, denominados técnicamente biomarcadores, los modelos matemáticos permitieron discriminar con una precisión del 94,45% un nuevo conjunto de muestras tumorales y no tumorales.

 

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