En el huésped sano, las bacterias entericas colonizan el tracto alimentario rápidamente luego del nacimiento y la composición de la microflora intestinal permanece relativamente constante a lo largo de la vida.
Al nacer el intestino es estéril, y al poco tiempo las bacterias coliformes maternas y estreptococos comienza a poblar el tubo digestivo seguidos luego por los lactobacilos y enterococos. A las tres semanas, el numero de coliformes disminuye y los Bacteroides se establecen como el microorganismo predominante en el colon. El tubo digestivo contiene al menos 500 especies bacterianas distintas, y el tipo de microorganismo y su concentración difieren a lo largo del mismo: el estomago contiene relativamente pocos microorganismos, mientras que los lactobacilos, enterococos, aerobios Gram + y anaerobio facultativos predominan en el intestino delgado proximal; por otra parte, el ileon terminal representa una zona de transición entre la flora aeróbica del intestino delgado proximal y la densa población de organismos anaerobios del colon (fundamentalmente Bacteroides). Cuando la válvula ileocecal es incontinente o esta ausente, la microbiología del ileon terminal se asemeja a la del colon.
Las bacterias entericas desempeñan un numero importante de funciones fisiológicas: 1) Las disacaridasas presentes en las bacterias colonicas permiten la absorción de azucares no digeribles en el intestino delgado median
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